Varangin niemimaan kansallispuiston hallinnon (Varangerhalvøya nasjonalparkstyre/ Várnjárgga álbmotmeahccestivra/ Varenkinniemen kansalistarhaan styyri) nimittää ympäristöhallitus, ja siihen kuuluu yksi edustaja kustakin alueen kunnista Vesisaari, Vuoreija, Båtsfjord ja Nesseby sekä maakunnan ehdottama jäsen sekä kaksi Saamelaiskäräjien edustajaa.
Kansallispuiston hallinto toteuttaa vuosittain toimenpiteitä, kuten hoitoa, tiedotusta ja käytön järjestelyjä. Hallinnolla on sihteeristö, joka koostuu kansallispuistonhoitajasta, jolla on toimisto Kibergissä ja Vesisaaressa. Hoitoviranomainen tekee Vesisaaressa ja Tana brussa tiivistä yhteistyötä Valtion luonnonvalvonnan (Statens naturoppsyn) kanssa, joka valvoo suojelualueita. Hoidon toteuttamisen puitteet ovat luettavissa kunkin suojelualueen suojelumääräyksistä.
Me hoidamme viittä suojelualuetta – suojelumääräykset:
Varangerhalvøya nasjonalpark /Várnjárgga álbmotmeahcci 
Persfjorden-Syltefjorden landskapsvernområde/ Biezavuona-Oardduvuona suodjemeahcci Syltefjorddalen naturreservat – Syltefjorddalen naturreservat/Oarddu luondumeahcci
Sandfjordneset naturreservat
Ytre Syltevika naturreservat
Varangin niemimaan kansallispuiston hallinto katselmuksella Ytre Syltevvikan luonnonpuistossa Foto: Geir Østereng